共生微生物群有助于肠道结构和形态的发育，调节免疫应答，保护免受肠道病原体，并且有助于更好地消化和吸收营养物。通过抑制病原菌和促进有益细菌来维持健康的肠道微生物群是必要的。
家禽的良好肠道健康与胃肠道微生物群落的正常生态平衡密切相关。肠道细菌通过其对肠形态，营养，肠道疾病的发病机理和免疫应答的影响在健康中起重要作用。微生物菌群也被认为保护免受病原体对肠的定植和刺激免疫应答。然而，许多因素可影响禽类细菌群落的组成，例如饮食，年龄，施用抗生素和感染病原生物体。动物微生物群落组成的变化可对动物宿主的健康，生长和成熟具有有益或有害的影响。
常见的肠道健康问题
I.传染
原生动物疾病 - 球虫病。
由大肠杆菌，沙门氏菌，梭菌(坏死性肠炎)，空肠弯曲杆菌和螺旋体引起的细菌感染导致潮湿的垫料。
病毒如REO，IB，IBD，新城疫 病毒，腺病毒，Rota病毒，Astro病毒，土耳其Corona病毒和Toro病毒引起腹泻。
寄生虫 - 蛔虫和绦虫侵袭导致腹泻。
II.无感染
A)饲料：结构和颗粒质量，适口性，配方和含量，霉菌毒素
B)管理：可用的饲料空间，水空间，饲养者分布，饮水器，空气质量，通风，垃圾，温度和密度
其中，坏死性肠炎和球虫病往往是最有害的，并且可以吞噬肉鸡生产者的利润，每只鸡高达0.10美元。
家禽肠道健康解决方案
抗生素生长促进剂(AGP)已经在家禽饲料 中全球使用60年。已知AGP可以改善饲料转化和生长，并减少由产气荚膜梭菌引起的疾病发病率。最近对科学界和消费者提出了对AGP的使用的关注。科学界正在讨论在动物中抗生素耐药性的问题。消费者正在了解AGP转移到人类的可能性。生产者担心长期使用，可能导致对常规抗生素的耐药性。因此，该行业正在重新思考全球动物饲料中AGP的使用，同事欧盟成为第一个禁止AGP的国家。
养殖领域已经开始探索替代抗生素(AGPs)的选择。这导致家禽中肠道健康问题的减少。
目前，人们对天然抗生素替代品更感兴趣。
抗生素替代品的标准
1. 预期抗生素替代物具有与AGP提供的相同的有益效果。
2. 减少病原体(梭菌属)
3. 抗炎效果
4. 对微生物群落有益细菌的积极影响
5. 肠壁活力
6. 对其他病原体如沙门氏菌和大肠杆菌的作用
7. 没有电阻问题
8. 动物表现的改善
抗生素的常用替代品是益生菌，益生元，有机酸和精油。两种或更多种以下产品的理想组合，将会取得更好的效果。
